A APERCIM tem como missão proporcionar bem-estar, qualidade de vida, autonomia e contribuir para o desenvolvimento integral ajustado às necessidades de cada pessoa, com e sem deficiência ou com problemas psiquiátricos, num clima de segurança afetiva e física, desde o seu nascimento e sem limite máximo de idade.
Ser reconhecida como entidade de excelência, promovendo a reabilitação, integração e participação ativa e plena na sociedade pelos seus clientes, satisfazendo as suas necessidades e das suas famílias.